確認してみましたが、自分の環境でも再現できませんでした。
更に、plugin.propertiesでbundle.descriptionの設定もできないようになりました。よって、意図通り、bundle.name, bundle.descriptionはbundle.propertiesのみで設定が有効になっていました。

astah-build, astah-launchの実行間隔が短い時不安定なときがあったので（あるいはマシンの問題か）、たまたま失敗していたのかもしれません。

確認のお手間を取らせてしまい、申し訳ありませんでした。