返信が若干遅くなってすみません。

JUDEの現在の仕様では
パーティション削除時にパーティションに属するアクション等も削除されます。

その為、入れ子のパーティション削除時に中身が消えてしまうのを
防ぎたい場合は、kzkamiyaさんのようなオペレーションが
必要になっております。

ご不便をお掛けしますが、しばらくはこのようなオペレーションで削除してください。
対応時期は未定ですが、改善リストに追加させて頂きます。
改善されるまでは、気長にお待ち頂ければ幸いです。