ブレインストームモードで。。。。

例えば、「蛍光ペン」という機能（ワードにもありますね）を作って、モデル要素をマーキングできる、というのはどうでしょうかね？単位は、「図でマウスで選べるもの」ならなんでも。選択状態にできるものに、「黄色」、「緑」、「ピンク」などのよく蛍光ペンで見る色を見やすくつける。