こんにちは。JUDEをいつも使わせていただいてます。
現在Linux環境でJUDEを常用していますが、時々キーボードからの入力を受け付けなくなってしまい、JUDEを再起動するしかなくなってしまいます。

環境
OS:Ubuntu Linux 7.10
JDK:1.6.0_03
試したJUDE
JUDE Professional 3.1.1(常用)
JUDE Professional 5.2 beta(最新版で動くか確認のためインストール)

Linux環境は非サポートになっていることは知っていますが、基本的な動作は非常に良好です。またWindows環境の時より画面が美しいので、好んで利用しています。

オフトピですが、5.2 betaではマインドマップのノード上でキーを押すだけで入力できてました。これまではF2を押す等入力モードにしないと入りませんでしたよね。間違えて入力してもCtrl+Zで戻せるのですが、事故を起こさないかちょっと不安でした。

Ubuntu + JDK6 で試してみましたが、簡単に問題が再現しますね。
Javaのサンプルアプリで、しかも日本語を使わなくても再現します。
それっぽいものがJavaのバグとしても挙がっているようでした。

Java5だと、だいじょうぶかもしれません。

簡単に確認しましたが、Java5でもダメなようです。
残念ですが、Ubuntuでは、JavaかOSのバージョンアップを待っていただく感じかと思います。（何か対処あるのかもしれませんが）

もしUbuntuで問題なく使われている方がいれば、情報お願いします。

まったく未確認ですが、
「java linux swing 入力」でぐぐったところ、
Java5とか6とかでトラブってる話が幾つがヒットしました。
https://www.xfytec.com/community/modules/newbb/viewtopic.php?topic_id=222&forum=22
http://blogs.sun.com/katakai/entry/bad_issue_for_swing_gtk
2つ目のURLでは逃げ設定やプログラム側での逃げ方が書いてある模様。(未確認ですが)

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A.nakamuraです。