こんにちは。度々お世話になります。
astah* community 6.5 を便利に利用させていただいています。
また、astah* professional 6.5 を現在試用させていただいています。

シーケンス図で、
ベースクラスを指定せずにライフラインを作った後に、
ベースクラスをアイコンのあるもの（バウンダリ等）に変更すると、
変更したばかりの見た目はアイコン表記で無いにも関わらず、
そのライフラインを右クリックして表示されるメニューの「アイコン表記」項目にはチェックマークが付きます。

その「アイコン表記」メニューをクリックすると、見た目がアイコン表記に切り替わりますが、
その状態でライフラインを右クリックしてメニューを確認すると、「アイコン表記」項目からはチェックマークが外れています。

つまり、チェックマーク状態があべこべになっています。
ファイルを保存して開き直すとチェックマーク状態は正常に戻ります。

お手数ですがご確認いただければと思います。