参考情報ありがとうございます。
今後、coLinuxやVMWareを使ってJUDEを動かしてみたいと思います。

少しLinuxマシンはあるのですが、今のところ動作確認はほとんど行われていません。いろんな環境も考えられることですし、多くのユーザの方が既に使われていそうなので、情報をもらえればと思っています。

apt-get そうなんですよね。