kangolです。

この方法は理解しています。ですがINDEXを対象とする
外部参照はモデルとしておかしくないですかということ
を言いたいのです。(3)で「主キー」か「INDEX名」が
選択できるところを「主キー」を含む関連先の全カラム
を選択肢としてもらえないでしょうか？

また、この方法では正しく作成した複合INDEXが候補に
なりません。カラムが絞れないことによるモデル管理の
都合だと思いますがINDEXではなくカラムをリストする
ことで解決できると思います。