nodeさん、astahのご利用ありがとうございます。

シーケンス図の停止（バツ印）は、選択して Deleteキーで削除できます。
選択状態が非常に分かりにくいので申し訳ないのですが、バツ印の下半分をクリックすると
選択できるかと思います。お試しください。